Man

Liliana Verónica Cambiazo Ayala

Associate Professor

UNIVERSIDAD DE CHILE - INTA

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Piscirickettsia salmonis genomics and host pathogen interactions; functional genomics in model and non-model species

Educación

  •  Molecular and Cellular Biology, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 1998
  •  Science, BRANDEIS UNIVERSITY. Estados Unidos, 1992
  •  Biological Sciences, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE. Chile, 1986

Experiencia Académica

  •   Associate Professor Full Time

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Instituto de Nutrición y Tecnología de Alimentos (INTA)

    Santiago, Chile

    Enero 1998 - A la fecha

Formación de Capital Humano


Tesis de doctorado

1. Javiera Ortiz. Elementos Genéticos Extracromosomales en Piscirickettsia salmonis: estudios de los factores de virulencia y su rol durante la infección in vivo e in vitro. Programa de Doctorado en Microbiología. Universidad de Chile. 2013-2017. Co-tutoría con Dr. Francisco Chavez

2. Carmen Bolatto. 2016. Estudio funcional de la proteína Patched-related durante el desarrollo embrionario de D. melanogaster. Programa de doctorado PEDECIBA. Universidad de la República, Uruguay.

2. Calixto Domínguez. 2013. Estudio de la regulación transcripcional activada por el morfógeno Dpp durante la formación del ectodermo dorsal en Drosophila melanogaster. Programa de Doctorado en Biotecnología. Universidad Andrés Bello.

3. Rodrigo Pulgar Tejo. 2012. Identificación de marcadores transcripcionales y análisis del efecto del hierro (Fe) y selenio (Se) sobre la resistencia a Piscirickettsia salmonis en salmón del Atlántico (Salmo salar). Programa de Doctorado en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Campus Sur, Universidad de Chile.

4. Alejandro Zuñiga Prado. 2010. caracterización funcional de la proteína RhoGEF3, un posible intercambiador de nucleótidos de RhoGTPasas. Programa de Doctorado en Bioquímica, Universidad de Chile.

5. Christian Hödar Quiroga. 2009. Estudio de la relación entre los perfiles de expresión génica durante el desarrollo embrionario de especies del género Drosophila y la conservación de las regiones reguladoras de los genes involucrados. Programa de Doctorado en Bioquímica, Universidad de Chile.

6. Talía del Pozo. 2009. Estudio de los perfiles de expresión génica de los componentes del metabolismo del cobre en Arabidopsis thaliana. Programa de Doctorado en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Campus Sur, Universidad de Chile (Co-tutoría).

7. Mauricio González-Agüero. 2006. búsqueda de genes asociados con la harinosidad de Prunus pérsica, mediante análisis de cambios en sus patrones de expresión. Programa de Doctorado en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Campus Sur, Universidad de Chile.

Tesis de Magister

1. Pamela Aravena. Estudio transcriptómico de la adaptación de Piscirickettsia salmonis al ambiente intracelular. Magister en Alimentos Saludables. INTA-Universidad de Chile. 2015-2017

2. Francisco Altimiras. 2013. Efecto del selenio sobre células SHK-1 infectadas con la bacteria intracelular de peces Piscirickettsia salmonis e identificación de sistemas de patogénesis. Programa de Magister en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile

3. Darko Cotoras. 2009. Conservación de redes de interacción génica implicadas en la formación de apéndices de Artrópodos (Drosophila melanogaster) y vertebrados (Danio rerio).
Programa de Magister en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias. Universidad de Chile.

Tesis de pregrado: 10
Unidades de investigación de estudiantes de postgrado: 7


Difusión y Transferencia


Transferencia
Patente
Pulgar Rodrigo, Cambiazo, Verónica, Mandakovic, Dinka, Glasner, Benjamín, Aravena Pamela CL 3575-2014. Método basado en PCR-RFLP para identificar y determinar pureza de Piscirickettsia salmonis, en una muestra. Aceptada 27 de agosto de 2017.
Registro de Marca
FastWine, Otorgada el 18-10-2017 (número de solicitud: 1222888).

Difusión
Zuñiga, A., Pulgar, R., Travisani, D., Cambiazo, V. Primer genoma completo de Piscirickettsia salmonis LF-89 (ATCC VR-1361). Revista Salmonexpert. Agosto 2015.
Pulgar R., Mandakovic D., Glasner B., Cambiazo V., González M. Selección de enzimas de restricción para la detección específica de Piscirickettsia salmonis por 16S rDNA PCR-RFLP. Revista Versión Diferente Salmón Acuícola. Edición de Mayo de 2016.
Lam N., Araneda C., Digenova A. Pulgar R., Maass A., Iturra P., Cambiazo V. Genómica de Salmónidos. Identificación de Genes Asociados al Uso de Proteínas y Aceites Vegetales en la Nutrición del salmón del Atlántico y de trucha arcoíris. Revista versión diferente Año 9., número 16, 2012.



Tipos de Producción
 

Journal Article (38)

Genomic-Based Restriction Enzyme Selection for Specific Detection of Piscirickettsia salmonis by 16S rDNA PCR-RFLP
Target genes of Dpp/BMP signaling pathway revealed by transcriptome profiling in the early
The bioleaching potential of a bacterial consortium.
Complete genome sequence of Microbacterium sp CGR1, bacterium tolerant to wide abiotic conditions isolated from the Atacama Desert
Complete genome sequence of Piscirickettsia salmonis LF-89 (ATCC VR-1361) a major pathogen of farmed salmonid fish
Identification and molecular characterization of five putative toxins from the venom gland of the snake Philodryas chamissonis (Serpentes: Dipsadidae)
Interplay between copper and zinc homeostasis through the transcriptional regulator Zur in Enterococcus faecalis
Spatial and temporal distribution of Patched-related protein in the Drosophila embryo
Transcriptional response of Atlantic salmon families to Piscirickettsia salmonis infection highlights the relevance of the iron-deprivation defence system
Comparative gene expression analysis of Dtg, a novel target gene of Dpp signaling pathway in the early Drosophila melanogaster embryo
Effects of postharvest treatments on gene expression in Prunus persica fruit: Normal and altered ripening
Physiological copper exposure in Jurkat cells induces changes in the expression of genes encoding cholesterol biosynthesis proteins
Genome wide identification of Acidithiobacillus ferrooxidans (ATCC 23270) transcription factors and comparative analysis of ArsR and MerR metal regulators
Transcriptomic response of Enterococcus faecalis to iron excess
Yeast-based assay identifies novel Shh/Gli target genes in vertebrate development
Gene expression profiling analysis of copper homeostasis in Arabidopsis thaliana
Genome-wide transcriptome analysis of the adaptive response of Enterococcus faecalis to copper exposure
Genome-wide transcriptome analysis of the adaptive response of Enterococcus faecalis to copper exposure
Comparative EST transcript profiling of peach fruits under different post-harvest conditions reveals candidate genes associated with peach fruit quality
Genes encoding novel secreted and transmembrane proteins are temporally and spatially regulated during Drosophila melanogaster embryogenesis
Overexpression of amyloid precursor protein increases copper content in HEK293 cells
Molecular characterization of a novel patched-related protein in Apis mellifera and Drosophila melanogaster
Cop-like operon: Structure and organization in species of the Lactobacillale order
Gene expression profiling in wild-type and metallothionein mutant fibroblast cell lines
Regulatory network for cell shape changes during Drosophila ventral furrow formation
Seasonal variation in the development of chilling injury in 'O'Henry' peaches
A Rapid and Efficient Method for Purifying High Quality Total RNA from Peaches (Prunus persica) for Functional Genomics Analyses
Identification of genes expressed during Drosophila melanogaster gastrulation by using subtractive hybridization
Copper overload affects copper and iron metabolism in HepG2 cells.
Cytoskeletal organization of human mesenchymal stem cells (MSC) changes during their osteogenic differentiation
Metallothionein is crucial for safe intracellular copper storage and cell survival at normal and supra-physiological exposure levels
Copper exposure modifies the content and distribution of trace metals in mammalian cultured cells
Discriminant analysis to evaluate clustering of gene expression data
Expression pattern of DMAP-85 during Drosophila embryonic development
Microtubule binding of the Drosophila DMAP-85 protein is regulated by phosphorylation in vitro
Bone extracellular matrix stimulates invasiveness of estrogen-responsive human mammary MCF-7 cells
The ?-isoform of heat shock protein hsp-90 is structurally related with human microtubule-interacting protein Mip-90
Tubulin domains for the interaction of microtubule associated protein DMAP-85 from Drosophila melanogaster

Grant (7)

Review (3)

Proteomic analysis of peach fruit mesocarp softening and chilling injury using difference gel electrophoresis (DIGE)
Identification of woolliness response genes in peach fruit after post-harvest treatments
JUICE: a data management system that facilitates the analysis of large volumes of information in an EST project workflow
55
Liliana Cambiazo

Associate Professor

Unidad de Nutrición Básica

UNIVERSIDAD DE CHILE - INTA

Santiago, Chile

23
Mauricio González

Associate Professor

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

15
Christian Hodar

ASSISTANT PROFESSOR

BIOINFORMATICS & GENEXPRESSION LAB - INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

7
Lee Meisel

Associate Professor

Institute of Nutrition and Food Technology (INTA), University of Chile

Macul, Chile

6
Rodrigo Pulgar

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

6
Herman Silva

Professor

Departamento de Produccion Agricola

Universidad de Chile

Santiago, Chile

5
Alejandro Maass

Professor/Director

Center for Mathematical Modeling

Universidad de Chile

Santiago, Chile

5
Angelica Reyes

Profesor Asistente

INTA UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

4
Jonathan Maldonado

Postdoc

Instituto de Nutrición y Tecnología de los Alimentos

Universidad de Chile

Santiago, Chile

3
Mauricio Gonzalez

Researcher

INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROPECUARIAS - CRI LA PLATINA

SANTIAGO, Chile

2
Felipe Olivares

Profesional

CENTRO REGIONAL LA PLATINA (INIA - PLATINA)

INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROPECUARIAS (INIA)

Santiago, Chile

2
PAULA VIZOSO

Researcher

Universidad Mayor

SANTIAGO, Chile

2
Ricardo Uauy

Professor

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile

1
Reinaldo Campos

Titular Professor - Director

Facultad de Ciencias Biológicas

Universidad Nacional Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Marco Nuñez

Professor

Biology

Fac. Ciencias, Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Andrés Tittarelli

Investigador Asociado

Fraunhofer Chile Research

Santiago, Chile

1
Ricardo Maccioni

DIRECTOR CIENTÍFICO

Investigación y desarrollo

CENTRO INTERNACIONAL DE BIOMEDICINA (ICC)

SANTIAGO, Chile

1
Igor Pacheco

Profesor Asistente

Laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica

INTA - Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Julio Aracena

Full Professor

Ingeniería Matemática

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

1
Andrea Morales

Académico de planta, encargada de Investigación

Salud

Universidad Santo Tomas

La Serena, Chile

1
Maria Cortés

Ingeniero de proyectos

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Verónica Palma

Profesor Titular

Biología

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Luis Milla

Profesor Asistente

Escuela de Medicina

Universidad de Santiago

Santiago, Chile

1
Jorge Martinez

Profesor Titular

Laboratorio de Biología Celular

INSTITUTO DE NUTRICIÓN Y TECNOLOGÍA DE ALIMENTOS (INTA), UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Nibaldo Inestrosa

Full Professor

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Juan Henriquez

Associate Professor

Cell Biology

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN, FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS, DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA CELULAR

Concepción, Chile

1
Waldo Cerpa

assistant professor

Biología Celular y Molecular

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile

1
Verónica Palma

Associate Professor

Biology

Universidad de Chile

Santiago, Chile